哥谭第二季延续了第一季的剧情，讲述了DC漫画中罪恶都市哥谭市的早期情况，第二季名为反派的崛起，其中讲述了各大DC反派和英雄的发展史，包括小丑早期的故事，艾德华·尼格玛（谜语人）开始步入歧途，企鹅人开始掌控哥谭，蝙蝠侠，猫女，毒藤女，稻草人等人幼年时期成长的故事。本季引入漫画反派“飞虎女”和她的哥哥Theo·Galvan——拥有亿万资产的实业家，自诩为哥谭的救世主，组织了阿卡姆疯人院首次越狱，包括芭芭拉，小丑等人，并利用他们组织犯罪活动
　　《哥谭》第二季第一集在美国时间9月21日晚回归。

哥谭市发生了重大转变，企鹅成为唯一的犯罪头目，勒布专员被迫退休。然而，随着加拉文家族来到哥谭，事情开始变得混乱。他们因一位祖先被羞辱而向韦恩家族报仇。

下半场，雨果·斯特兰奇教授开始尝试复活死者并赋予他们非自然的能力。

戈登被解雇，布洛克辞去警察职务。戈登与现已成为犯罪头目的科布尔波特合作，迫使勒布局长恢复戈登的侦探身份并辞去警察局长的职务，以换取戈登向某人收取债务，并遗憾地杀死他们以保护自己。与此同时，阿卡姆疯人院的几名囚犯，包括芭芭拉·基恩、亚伦·赫尔辛格、杰罗姆·瓦莱斯卡、阿诺德·多布金斯、理查德·西奥尼斯和罗伯特·格林伍德，被西奥·加勒文（詹姆斯·弗莱恩饰）和他的妹妹/执法者塔比莎·加拉文（杰西卡·卢卡斯饰）从疯人院救了出来。。除西奥尼斯外，所有人都同意与加勒文联手；西奥尼斯因拒绝而被勒死并刺死。布鲁斯和阿尔弗雷德在楼梯尽头发现了一个秘密房间。当阿尔弗雷德干扰他探索父亲的电脑时，布鲁斯解雇了他，但当阿尔弗雷德同意对他进行身体训练，以便他能够对抗杀害他父母的凶手时，布鲁斯改变了主意。加拉文绑架了市长，他的“Maniax”组织为了宣传而开始了一场公开的谋杀狂潮。马尼亚克斯人袭击了 GCPD，杀死了包括埃森在内的几名警察；尼格玛在大屠杀中为救克林格尔小姐而受伤。此后，布洛克重新加入部队阻止马尼亚克斯。戈登和布洛克寻找杰罗姆，但发现保罗·西塞罗（杰罗姆的父亲）已经被谋杀，加勒文透露是他的家族建造了哥谭，他正在向那些玷污他家族名誉的人报仇。加勒文参加了一场慈善活动，阿尔弗雷德、布鲁斯和莱斯利·汤普金斯也参加了，结果证明这是一个精心设计的诡计，加勒文杀死了杰罗姆，并被认为是英雄；他宣布竞选市长。一些哥谭市民在电视上看到杰罗姆的行为并开始精神崩溃。GCPD 的新任队长纳撒尼尔·巴恩斯（迈克尔·切克利斯饰）前来清理该部门并消除腐败。在戈登的协助下，他们从警察学院招募了几名有抱负的警察实习生，组成一支精英团队来实现这一目标。加勒文绑架了科波特的母亲，并勒索科波特谋杀所有其他候选人，以便加勒文能够毫无反对地竞选市长。当塞琳娜开始在布鲁斯的预科学校寻找他时，她被阿尔弗雷德命令离开，因为她杀死了雷吉。不久之后，布鲁斯会见了加拉文，感谢他在慈善活动中救了自己的命，并见到了加拉文的侄女西尔弗·圣克劳德（娜塔莉·阿琳·林德））。尼格玛和克林格尔小姐一起度过了一个浪漫的夜晚。当科波特开始让布奇悄悄寻找他的母亲时，巴恩斯上尉指挥突击队瞄准科波特。科波特和布奇把一个箱子交给加拉万的顶层公寓，里面有一个被绑架的席德·邦德斯劳，塔比莎摘下了他的一只眼睛。与此同时，由巴恩斯和戈登上尉领导的 GCPD 突击队捣毁了科布尔波特的一个洗钱场所，他们差点被一名携带火箭推进式手榴弹的男子杀死。加拉万到达 GCPD，在那里他提供帮助清理 GCPD 的腐败行为，以换取对他候选人资格的支持。戈登温和地拒绝了，声称警察和政治不匹配。塔比莎拜访科布尔波特，讨论他们的下一步行动，这需要雇用纵火犯。戈登和布洛克在一次潜在的抢劫中伏击了布里吉特，他们的兄弟抛弃了她。当她试图后退时，警官卢克·加勒特（伦尼·普拉特）试图阻止她，但她不小心烧伤了他。她和塞琳娜一起逃脱，但加勒特警官后来死于火灾。加拉万再次拜访 GCPD，戈登决定支持他的候选人资格。克里尔神父（罗恩·里夫金饰）拜访了加拉文，并递给他一把刀，声称他的战士们已经在路上了，布鲁斯·韦恩将会死去。在离开派克兄弟并与塞琳娜住在一起后，布里奇特·派克在试图离开哥谭市后被派克兄弟绑架并进一步虐待。布里吉特开枪杀害了其他派克兄弟，开始了犯罪热潮。参观完塞琳娜的藏身处后，戈登和布洛克到达派克兄弟的公寓，发现他们已经死了。西奥·加拉文继续引诱布鲁斯·韦恩，这一次主动提出帮助清理韦恩企业的腐败行为。布奇发现了科波特母亲的下落，科波特开始召集救援队。布丽吉特·派克在与 GCPD 打击部队的斗争中丧失了行动能力，并公开宣布死亡，这让塞琳娜非常沮丧。克里斯汀·克林格尔得知尼格玛谋杀了多尔蒂警官。为了阻止克林格尔告诉任何人，尼格玛无意中勒死了她。与此同时，派克还活着，但她的整个身体都被烧毁了。她被带到印第安山，这是韦恩企业的一个地下部门，那里秘密进行不人道的实验。据说她的衣服已经融化在她身上，使她防火。